Ametyst je trojdílný krystalový systém, krystal je šestihranný sloupcový, válcová plocha je příčná, má levý tvar a pravý tvar, velmi rozšířený je dvoukrystal.Tvrdost je 7. Krystal často obsahuje nepravidelné nebo okřídlené plynokapalinové inkluze.